Хуэйская медицина сложилась на основе синтеза традиционной китайской медицины и арабско-исламской медицины. В период династий Цзинь-Юань хуэйская медицина и фармакология находилась на пике своего развития. В тот период были написаны многие медицински трактаты и фармакопеи, например, фармакопея «Рецепты хуэйской медицины». В этой книге содержатся  рецепты, напоминающие по своему составу препараты китайской медицины с применением пилюлей, порошков, экстрактов, отваров, и препараты, заимствованные из арабской медицины с применением фитотерапии, ароматерапии, настоек, капель, сиропов т. д.  

На протяжении своего длительного развития, в хуэйской медицине сложились оригинальные методы лечения, которые относятся к сфере диетического питания. Это связана с тем, что хуэйцы искусны в кулинарии.