Две тысячи лет назад территория Синьцзяна входила в состав земель многонационального Китая. В 60 г. до н.э. власти династии Хань учредили в Синьцзяне административное ведомство – Палату по охране столицы Западного края для прямого управления Синьцзяном, границы которого простирались в то время от современного озера Баграшкёль до Памира. Вследствие этого на протяжении более чем 1000 лет Синьцзян находился в подчинении центральных властей Китая.

300 лет назад в период господства династии Цин власти Китая в городке Суйюань учредили должность Илийского генерал-губенатора, в ведомство которого входила вся территория Синьцзяна. В 1884 г. в Синьцзяне началось провинциальное административное строительство. 

В сентябре 1949 г. Синьцзян был мирно освобожден. Начиная с 1 октября 1949 г., т.е. со дня образования КНР Синьцзян стал автономным районом Китая провинциального уровня.