В 1984 году Мэгги начала свою актерскую карьеру. Ее кинодебют состоялся в 1984 году в романтической комедии «Прекрасный принц», снятой знаменитым режиссером Ван Цзином.
1985-1986 годы не были самыми яркими в ее карьере, но за два этих года она успела сняться в паре заметных фильмов: с Джеки Чаном в «Полицейской истории», с Чжоу Жуньфа в «Седьмом проклятии» и «Розе», а также третьей части популярного сериала «Счастливый призрак». А уже в следующем, 1987 году, актриса снялась сразу в семи картинах.
Во многих интервью Мэгги называет 1988 год годом своего рождения как актрисы. Тогда она, несмотря на постоянное участие в комедиях, согласилась попробовать себя в драме «Пока не высохнут слезы» – дебютной картине режиссера Вонга Карвая. Для Мэгги открылся целой новый мир драмы, и в последующие годы она еще не раз снялась у Вонга Карвая, а также охотно поработала с арт-режиссерами Гонконга и континентального Китая.
В 1993 году Мэгги снялась в двенадцати фильмах, в 1994 в свет вышло лишь две картины с ее участием, а в 1995 ни одной. Частично перерыв работе был связан с избыточным вниманием прессы. Дошло до того, что одно издание опубликовало ее любовные письма.
Спустя время актриса вернулась к работе и начала сниматься у французских режиссеров: сперва у Энн Фонтейн в картине «Августин», затем у Оливье Ассаяса в фильме «Ирма Веп». В Гонконге в 1996 году актриса снялась только в одном фильме – романтической драме «Товарищи. Почти история любви», которая набрала достаточную популярность в Китае.
После съемок «Ирмы Веп» между Мэгги и Оливье завязался роман и в 1998 году они поженились. Все это время Мэгги чередовала съемки на родине с участием в международных проектах. Ее авторитет на международной арене значительно вырос: в 1997 году она попала в жюри Берлинского Кинофестиваля, а в 1999 –Венецианского. Очень много времени актриса потратила на съемки в фильме «Любовное настроение» Вонга Карвая. Режиссер несколько раз останавливал проект, переделывая все заново.
Брак с Ассаясом распался в 2001 году, хотя бывшие супруги сохранили хорошие отношения. Впоследствии Мэгги еще снимется у Оливье – в драме «Очищение».
В нулевых активность Мэгги в кино снизилась еще больше: с 2001 по 2004 год она снялась всего в трех фильмах, а затем и вовсе ушла из кино.
В 2007 году на 10-м Шанхайском международном кинофестивале Мэгги Чун была удостоена награды «За выдающийся вклад в китайский кинематограф».